MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 1616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	ATG	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
2	NC_013767	GATTG	2	10	179	188	20 %	40 %	40 %	0 %	284803267
3	NC_013767	GGA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803267
4	NC_013767	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	284803267
5	NC_013767	ATG	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
6	NC_013767	TTG	2	6	288	293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803267
7	NC_013767	CA	3	6	364	369	50 %	0 %	0 %	50 %	284803267
8	NC_013767	TTTAAT	2	12	400	411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
9	NC_013767	TTA	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
10	NC_013767	GAA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
11	NC_013767	TGAT	2	8	510	517	25 %	50 %	25 %	0 %	284803267
12	NC_013767	GAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
13	NC_013767	A	7	7	661	667	100 %	0 %	0 %	0 %	284803267
14	NC_013767	ATG	3	9	684	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
15	NC_013767	GTACA	2	10	720	729	40 %	20 %	20 %	20 %	284803267
16	NC_013767	CTC	2	6	821	826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284803267
17	NC_013767	AGTA	2	8	862	869	50 %	25 %	25 %	0 %	284803267
18	NC_013767	AAC	2	6	908	913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803267
19	NC_013767	CAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
20	NC_013767	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
21	NC_013767	ATC	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
22	NC_013767	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803267
23	NC_013767	CTC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284803267
24	NC_013767	AAG	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
25	NC_013767	TAA	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
26	NC_013767	ATA	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
27	NC_013767	A	6	6	1325	1330	100 %	0 %	0 %	0 %	284803267
28	NC_013767	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
29	NC_013767	CAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803267
30	NC_013767	TAT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
31	NC_013767	AAAG	2	8	1481	1488	75 %	0 %	25 %	0 %	284803267
32	NC_013767	TAT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
33	NC_013767	ATA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
34	NC_013767	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
35	NC_013767	GAA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
36	NC_013767	AAAG	2	8	1628	1635	75 %	0 %	25 %	0 %	284803267
37	NC_013767	TAT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
38	NC_013767	ATG	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
39	NC_013767	ATG	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
40	NC_013767	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
41	NC_013767	T	6	6	1813	1818	0 %	100 %	0 %	0 %	284803267
42	NC_013767	A	6	6	1828	1833	100 %	0 %	0 %	0 %	284803267
43	NC_013767	A	7	7	1841	1847	100 %	0 %	0 %	0 %	284803267
44	NC_013767	TGG	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803267
45	NC_013767	CTG	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803267
46	NC_013767	ATC	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
47	NC_013767	ATTAAA	2	12	2002	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
48	NC_013767	A	7	7	2038	2044	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
49	NC_013767	ATG	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803268
50	NC_013767	GAAA	2	8	2133	2140	75 %	0 %	25 %	0 %	284803268
51	NC_013767	ATGAT	2	10	2156	2165	40 %	40 %	20 %	0 %	284803268
52	NC_013767	GAAA	2	8	2185	2192	75 %	0 %	25 %	0 %	284803268
53	NC_013767	A	6	6	2190	2195	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
54	NC_013767	TTC	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803268
55	NC_013767	A	6	6	2214	2219	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
56	NC_013767	A	6	6	2251	2256	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
57	NC_013767	GAAAG	2	10	2295	2304	60 %	0 %	40 %	0 %	284803268
58	NC_013767	A	7	7	2379	2385	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
59	NC_013767	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
60	NC_013767	ACA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
61	NC_013767	TGGA	2	8	2471	2478	25 %	25 %	50 %	0 %	284803268
62	NC_013767	GAAAA	2	10	2504	2513	80 %	0 %	20 %	0 %	284803268
63	NC_013767	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
64	NC_013767	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803268
65	NC_013767	ATC	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803268
66	NC_013767	TTA	2	6	2614	2619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803268
67	NC_013767	TA	4	8	2618	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
68	NC_013767	AAT	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
69	NC_013767	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
70	NC_013767	A	6	6	2710	2715	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
71	NC_013767	AAGATG	2	12	2735	2746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284803268
72	NC_013767	AAC	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
73	NC_013767	AAG	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803268
74	NC_013767	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
75	NC_013767	AT	3	6	2889	2894	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
76	NC_013767	GGC	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284803268
77	NC_013767	AATT	2	8	2940	2947	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
78	NC_013767	AAGAA	2	10	2961	2970	80 %	0 %	20 %	0 %	284803268
79	NC_013767	AGA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803268
80	NC_013767	TTG	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803268
81	NC_013767	ATG	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803268
82	NC_013767	ATT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803268
83	NC_013767	A	6	6	3059	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
84	NC_013767	ACT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803268
85	NC_013767	A	7	7	3097	3103	100 %	0 %	0 %	0 %	284803268
86	NC_013767	GAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803268
87	NC_013767	CAAAT	2	10	3245	3254	60 %	20 %	0 %	20 %	284803269
88	NC_013767	CTT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
89	NC_013767	TTA	2	6	3394	3399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803269
90	NC_013767	TGCACT	2	12	3410	3421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284803269
91	NC_013767	CGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803269
92	NC_013767	A	6	6	3470	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	284803269
93	NC_013767	ATC	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
94	NC_013767	T	6	6	3621	3626	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
95	NC_013767	TTC	2	6	3707	3712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
96	NC_013767	TCA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
97	NC_013767	TGA	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
98	NC_013767	TAA	2	6	3761	3766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
99	NC_013767	AAT	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
100	NC_013767	T	6	6	3810	3815	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
101	NC_013767	TTC	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
102	NC_013767	AAGC	2	8	3935	3942	50 %	0 %	25 %	25 %	284803269
103	NC_013767	TC	3	6	3963	3968	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
104	NC_013767	AAC	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803269
105	NC_013767	ATG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
106	NC_013767	ATTG	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	284803269
107	NC_013767	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
108	NC_013767	ATTC	2	8	4292	4299	25 %	50 %	0 %	25 %	284803269
109	NC_013767	TAA	2	6	4307	4312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
110	NC_013767	TTTTC	2	10	4327	4336	0 %	80 %	0 %	20 %	284803269
111	NC_013767	T	7	7	4454	4460	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
112	NC_013767	T	7	7	4499	4505	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
113	NC_013767	AAT	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
114	NC_013767	ATC	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
115	NC_013767	AGTG	2	8	4610	4617	25 %	25 %	50 %	0 %	284803269
116	NC_013767	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
117	NC_013767	CTTC	2	8	4674	4681	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
118	NC_013767	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803269
119	NC_013767	T	6	6	4710	4715	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
120	NC_013767	CTT	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
121	NC_013767	T	6	6	4790	4795	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
122	NC_013767	T	6	6	4845	4850	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
123	NC_013767	ATTT	2	8	4856	4863	25 %	75 %	0 %	0 %	284803269
124	NC_013767	TCT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
125	NC_013767	TCT	2	6	5016	5021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
126	NC_013767	ATCA	2	8	5108	5115	50 %	25 %	0 %	25 %	284803269
127	NC_013767	GATC	2	8	5239	5246	25 %	25 %	25 %	25 %	284803269
128	NC_013767	TGA	3	9	5253	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
129	NC_013767	A	6	6	5268	5273	100 %	0 %	0 %	0 %	284803269
130	NC_013767	T	7	7	5292	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
131	NC_013767	GAA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803269
132	NC_013767	ATTG	2	8	5387	5394	25 %	50 %	25 %	0 %	284803269
133	NC_013767	T	6	6	5426	5431	0 %	100 %	0 %	0 %	284803269
134	NC_013767	CT	3	6	5448	5453	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
135	NC_013767	TA	3	6	5512	5517	50 %	50 %	0 %	0 %	284803269
136	NC_013767	AAC	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803269
137	NC_013767	AGA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803269
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271	NC_013767	ATAA	2	8	12250	12257	75 %	25 %	0 %	0 %	284803277
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394	NC_013767	CCA	2	6	18851	18856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284803283
395	NC_013767	A	7	7	18856	18862	100 %	0 %	0 %	0 %	284803283
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